Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SMIM3Q9BZL3 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms