Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
UBXN4Q92575 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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