Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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