Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
NBR1Q14596 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms