Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CUL4BQ13620 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CUL4BQ13620 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms