Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
BPTFQ12830 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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