Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms