Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
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