Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
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PTPRBP23467 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PTPRBP23467 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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