Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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