Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CAPN6Q9Y6Q1 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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