Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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