Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CIPCQ9C0C6 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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