Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms