Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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