Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CTXN3Q4LDR2 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms