Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RYR3Q15413 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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