Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TRAM2Q15035 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms