Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SSPNQ14714 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms