Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4AQ13619 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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