Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
MTMR3Q13615 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms