Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TCIRG1Q13488 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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