Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
CHAF1BQ13112 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
CHAF1BQ13112 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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