Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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