Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RBBP4Q09028 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms