Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
RPS29P62273 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RPS29P62273 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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