Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PGGT1BP53609 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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