Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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PTPRMP28827 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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