Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CTSSP25774 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CTSSP25774 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms