Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPRGP23470 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms