Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CDH13-201ENST00000268613 2722 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPREP23469 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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