Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRDP23468 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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