Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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HOXA2O43364 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXA2O43364 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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