Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AL358334.3-201ENST00000557343 535 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC118757.1-202ENST00000589074 609 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 KNG1-201ENST00000265023 3435 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SULT1C2-202ENST00000326853 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AGBL4-203ENST00000371838 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SPATA19-201ENST00000299140 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GCNT1P5-201ENST00000449274 682 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 IGHV7-40-201ENST00000520963 296 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC122688.2-201ENST00000543922 585 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GNG2-215ENST00000557376 573 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RN7SL376P-201ENST00000578594 264 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RPL23AP90-201ENST00000603820 236 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LZTS1-204ENST00000616228 231 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC026398.1-201ENST00000413683 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC105760.1-201ENST00000244820 2231 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ERI2-215ENST00000569729 2646 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 AHSP-201ENST00000302312 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU1-21P-201ENST00000363327 163 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SNPHO15079 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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