Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1Q9NPL8 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms