Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRIM5Q9C035 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRIM5Q9C035 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms