Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms