Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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UBXN4Q92575 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
UBXN4Q92575 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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