Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
LAMA3Q16787 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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