Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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