Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CCDC85BQ15834 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms