Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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GAPVD1Q14C86 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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GAPVD1Q14C86 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GAPVD1Q14C86 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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