Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTCH1Q13635 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTCH1Q13635 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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