Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NEUROD1Q13562 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms