Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC00489-201ENST00000457816 543 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NDUFS5P2-201ENST00000484004 306 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 IGLVIV-59-201ENST00000520218 250 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 HHLA3-207ENST00000531950 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 TEP1-201ENST00000262715 10695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 USP37-204ENST00000418019 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
MKRN4PQ13434 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FANCM-201ENST00000267430 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ABCB4-203ENST00000359206 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SLC11A2-202ENST00000262052 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SNORA70I-201ENST00000384544 135 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ISY1-202ENST00000393292 988 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GLYCTK-AS1-203ENST00000493616 445 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC010653.3-201ENST00000635332 232 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 BCL2L11-224ENST00000639340 243 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MAPK10-233ENST00000515650 2394 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MAPK10-204ENST00000395157 2665 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LOXHD1-201ENST00000300591 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZRANB1-201ENST00000359653 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 LINC00460-201ENST00000435024 631 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
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