Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
TRIM28Q13263 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TRIM28Q13263 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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