Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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TRAF1Q13077 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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