Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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HOXD10P28358 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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HOXD10P28358 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
HOXD10P28358 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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