Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPREP23469 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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