Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MLH3-202ENST00000380968 7819 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms